由于真空管在空晒时，管内温度能达到250℃左右，故在水箱内无水或第一次上水时必须在日出前或太阳落山半小时后进行。
   太阳能热水器都有溢流管，可根据溢流管是否排水判断水位状态。也可配备水位控制仪，水满会自动报警。
   真空管太阳能热水器效率高，在夏季晴天的情况下，不到两天水温可达沸点，若长时间不用水，如出差、旅游时，水箱内长时间处于高温、高压的状态下，会促进密封圈的老化。有时排气不畅通，压力太大还会使水箱胀坏，结水垢，缩短水箱的寿命。因此，若你长期不在家，应安排别人经常放热水上冷水，或者在真空管集热器上放置遮盖物挡住阳光，待回家后，再除去。
   太阳能热水器好几天未用的水一般都是较热的水，温度能达70℃以上，尤其在夏天晴朗天气超过2天，水就会沸腾，到夜间会适当降温，水温保持在60℃－70℃区域时间很长，而这个温度区域是水中细菌繁殖的极佳温度，因此，如好几天或长期不用的热水，水质较差，细菌多，要排放掉。不要洗澡或用来烧开水饮用。这样的水洗澡对皮肤不利，长期使用这种水洗澡会引发皮肤病。